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CV-1残留DNA检测试剂盒 (PCR-荧光探针法)
100 Reactions
Cat No. 1101105
库存:现货
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产品介绍

SHENTEK® CV-1 残留 DNA 检测试剂盒(PCR-荧光探针法)用于定量检测各种生物制品的中间品、半成品和成品中 CV-1 宿主细胞 DNA 的专用试剂盒。

本试剂盒利用荧光探针原理,定量检测样品中 CV-1 残留 DNA。检测快速,专一性强,性能可靠,最低检测限可以达到 fg 水平。试剂盒配套有 CV-1 DNA 定量参考品。本试剂盒与 SHENTEK®宿主细胞残留 DNA 样本前处理试剂盒配套使用,可准确定量样品中 CV-1 残留 DNA。

n  试剂盒简介

SHENTEK® CV-1 残留 DNA 检测试剂盒(PCR-荧光探针法)用于定量检测各种生物制品的中间品、半成品和成品中 CV-1 宿主细胞 DNA 的专用试剂盒。

本试剂盒利用荧光探针原理,定量检测样品中 CV-1 残留 DNA。检测快速,专一性强,性能可靠,最低检测限可以达到 fg 水平。试剂盒配套有 CV-1 DNA 定量参考品。本试剂盒与 SHENTEK®宿主细胞残留 DNA 样本前处理试剂盒配套使用,可准确定量样品中 CV-1 残留 DNA。

该试剂盒仅供研究使用,不可用于临床。

n  试剂盒组分

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n 

100 Reactions。

n  有效期

规定储存条件下 24 个月,具体详见试剂盒标签。

n  适用机型(包括但不限于)

1.  SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统

2.  7500 Real-Time PCR System

3.  CFX96 定量 PCR 系统

4.  LineGene 9600plus 定量 PCR 系统

n  实验所需但试剂盒中未含材料

1.  1.5 mL 无菌低吸附离心管

2.  qPCR 板或条(与所使用的定量荧光 PCR 仪相适应)

3.  1000 μL,100 μL,10 μL 无菌低吸附带滤芯枪头

n  相关设备

1.  荧光定量 PCR 仪

2.  1000 μL,100 μL,10 μL 移液枪

n  实验操作流程

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1 操作流程示意图

一、试剂、仪器准备

(一)实验前准备:

1.         穿戴无 DNA 污染的工作服、一次性乳胶手套、一次性无纺布帽子。

2.         工作台面、移液枪及离心管架紫外照射 30 分钟,喷洒 75%酒精并擦干。

3.         将试剂盒从冰箱-18 ℃以下区域转移至 2-8 ℃区域或冰上融化,涡旋振荡混匀并瞬时离心。

(二)qPCR 反应液准备:

1.反应孔数计算:根据检测样品的数量,计算所需反应孔数,一般做 3个重复孔/样。

反应孔数=(6 个浓度梯度的标准曲线+ 1 个无模板对照 NTC+ 1 个阴性质控 NCS +待测样品×2)×3待测样品×2 是因为我们推荐每个待测样品检测时都应同时做样品ERC。

 2.MIX 总量计算:根据反应孔数计算所需 MIX 总量。

MIX 总量 =(反应孔数+2)× 20 μL(含有 2 孔的损失量)

3qPCR MIX 配制:根据表 2 配制表准备各试剂 qPCR MIX 用量。2. qPCR MIX 配制表

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二、样品准

l CV-1 DNA 定量参考品的稀释和标准曲线的制备

CV-1 DNA  定量参考品浓度标注于管壁标签上,请确认浓度后再进行稀释。

用试剂盒中提供的 DNA 稀释液将定量参考品进行稀释,具体操作如下:

1.      将试剂盒中的CV-1 DNA 定量参考品和DNA 稀释液置于冰上或2-8℃条件下融化。待完全融化后,轻弹数下混匀,短时间快速离心 3-5 秒,如此重复 3 次。

2.      取 7 支干净的 1.5 mL 离心管,分别标记为 ST0,ST1,ST2,ST3, ST4,ST5,ST6。

3.      在ST0 管中用 DNA 稀释液将CV-1 DNA 定量参考品稀释至 3 ng/μL,振荡混匀后短时间快速离心 3-5 秒,重复 3 次以确保定量参考品与 DNA 稀释液充分混匀。

4.      在 ST1,ST2,ST3,ST4,ST5,ST6 管中分别加入 90 μLDNA 稀释液。

5.      按表 3 依次进行 6 次稀释操作。

image.png

已融化未使用的 DNA 稀释液可保存于 2-8 ℃。

若 DNA 稀释液中有析出,建议于 37 ℃条件下进行孵育。

标准曲线浓度点可根据实际验证结果选择,应至少有 5 个浓度点。

l 加标回收(ERC)

根据需要设置ERC 中的 CV-1 DNA 加样浓度(以制备加 30 pg CV-1 DNA量的样品 ERC 为例),具体操作如下:

1.      取 100 μL 待测样品加入 1.5 mL 干净的离心管中。

2.      再加入 10 μL ST3,混匀,标记为样品 ERC。

备注:样品ERC 和同批待测样品一起进行样品前处理,制备成样品ERC纯化液。

l 阴性对照(NCS)

1. 取 100 μL DNA 稀释液加入 1.5 mL 干净的离心管中,标记为阴性质控NCS。

备注:阴性质控 NCS 和同批待测样品一起进行样品前处理,制备成阴性质控 NCS 纯化液。

三、操作步

(一)加

1.       各试剂置于冰上,轻微振荡混匀,按表 4 和表 5 所示加样:

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²  该示例表示的是检测 6 个浓度梯度的 CV-1 DNA 标准曲线ST1ST6)、 1 个无模板对照 NTC1 个阴性质控 NCS5 个待测样品(S1S5)和每个样品的 ERCS1 ERCS5 ERC每个检测做 3 个重复孔。

²  实际检测时可根据样品多少,参照此示例进行 96 孔板排版加样。

2.   96 孔板用光学膜封闭,轻微振荡混匀,短时间快速离心10 秒后放入qPCR仪。

(二)qPCR 程序设

l  SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例:

1.         点击“实验向导”。

2.         “孔板编辑”页面中选择步骤 1:选择反应孔。

3.         选择步骤 2:选择项目中的“CV-1 残留 DNA”程序。

4.         “实验运行”页面中点击“开始”运行程序。

l  其他定量 PCR 系统程序设置如下:

1.    创建空白新程序,选择绝对定量检测模板。

2.  创建新检测探针,命名为 CV-1-DNA,选择报告荧光基团为 FAM,猝灭荧光基团为 none,检测参比荧光为 ROX(可选)。

3.    设置两步法反应程序:95 ℃预变性 10 分钟;95 ℃ 15 秒,60 ℃ 1 分钟(读取荧光),40 个循环;反应体积 30 μL。

四、结果计算与判断

(一)结果计

l  以 SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例: 1.“孔板编辑”页面中步骤 3:定义反应孔,将标准曲线孔的选择样品类型设置为标准品,并在标品赋值中分别根据表 2 赋值,“CV-1 残留 DNA”分别设为 300、30、3、0.3、0.03、0.003,并且在相应的“样本名称”中命名为 ST1、ST2、ST3、ST4、ST5、ST6。

2.   待测样品将样品类型设置为待测样品,NTC 将样品类型设置为无模板对照。

3.   在“实验分析”页面点击image.png,可读取标准曲线的斜率、截距、相关系数、扩增效率。

4.   在“反应孔信息表中”可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值,单位为 pg/μL。

l  以 7500 Real-Time PCR System、软件版本 1.4 为例:

1.   在 Results 的 Amplification Plot 面板中,将 Threshold 设置为 0.02,点击 Analyze,此时可初步查看扩增曲线的形态是否正常。

2.   在Results 的Plate 面板中,将标准曲线孔的 Task 一栏设置为Standard,并且在 Quantity 一栏分别赋值为 3000、300、30、3、0.3、0.03(含义为每孔的 DNA 总量,单位为 pg),并且在相应的 sample name 一栏中命名为 ST1、ST2、ST3、ST4、ST5、ST6。

3.       在 Results 的 Plate 面板中,将无模板对照 NTC 孔的 Task 一栏设置为NTC,将阴性质控 NCS 孔、待测样品孔、样品 ERC 孔的 Task 一栏设置为 Unknown,并且在相应的 Sample Name 一栏中命名为 NTC、NCS、 S、ERC,之后点击图片1.jpg

4.   在 Results 的 Standard Curve 面板中,可读取标准曲线的斜率(Slope)、截距(Intercept)、R2。

5.   在 Results 的 Report 面板中,Mean Quantity 一栏可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品、样品 ERC 的检测值,单位为 pg/10μL。后续可在检测报告中将单位换算为 pg/μL 或 pg/mL。

(二)结果判

1.   根据待测样品和样品 ERC 的检测结果计算加样回收率,加样回收率要求在 50%~150%之间。

2.   NTC 的检测结果应为 Undetermined 或 Ct 值≥35,或根据实验室自身验证结果设定具体标准。

3.   NCS 的 Ct 均值应大于标曲最低浓度 Ct 均值,若经验证的定量限浓度低于标曲最低浓度,则 NCS 的检测值应小于定量限浓度。

上述示例结果分析的参数设置仅供参考,具体需依据实验室的机型及使用的软件版本进行设定,一般也可由仪器自动判读。

 

 

 

修订日期:2023 07 05

生效日期:2023 07 06

 


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