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毕赤酵母残留DNA检测试剂盒 (PCR-荧光探针法)
100测试
Cat No. SK030205P100
库存:现货
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产品介绍

产品信息:

• 检测类型:定量检测

• 产品规格:100测试

• 适用样品类型:对各种生物制品及药品的中间品、半成品和成品中残留的毕赤酵母细胞DNA进行分析。

• 线性范围:3.00E+02pg/μL~1.00E-02pg/μL;R2≥0.990;扩增效率为95%

• 样品回收率:50-150%

• LLOQ:1.00E-02pg/μL

• 专属性:不受CHO、E.coli、Vero等常见工程细胞基因组DNA的干扰。

• 精密度:中间精密度及重复性实验CV值均在30%以内。

• 耐用性:至少反复冻融5次检测性能不受影响。

• 仪器适用性(包括但不限于以下设备):湖州申科SHENTEK-96S、Thermo ABI7500、Bio-Rad CFX-96、Roche LightCycler480

产品特点:

• 操作简单:搭配SHENTEK前处理设备及试剂盒,可实现自动化提取及检测。

• 灵敏度高:定量下限低至1.00E-02pg/μL,满足实际检测需求。

• 性能稳定:试剂盒重复实验间结果稳定,均满足精密度需求。

• 质量可控:试剂盒按照药典、法规完成各项检测指标的性能验证。

质量保证:

• 建立ISO13485质量管理体系,具有完善的从研发、生产、质检的产品开发流程。

• 生产高度设备化,历史多批次生产稳定,供应链完善。

n  试剂盒简介

毕赤酵母残留 DNA 检测试剂盒用于定量检测各种生物制品及药品的中间品、半成品和成品中毕赤酵母宿主细胞 DNA 的专用试剂盒。

本试剂盒利用荧光探针原理,定量检测样品中毕赤酵母残留 DNA。检测快速,专一性强,性能可靠,最低检测限可以达到fg 级别。试剂盒配套有毕赤酵母 DNA 定量参考品。本试剂盒与 SHENTEKTM 宿主细胞残留 DNA 样本前处理试剂盒配套使用,可准确定量样品中残留的微量毕赤酵母细胞 DNA。

n  试剂盒组

image.png 

n 

100 Reactions。

n  有效期

规定储存条件下 24 个月,具体详见试剂盒标签。

n  适用机型(包括但不限于

Ø SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统

Ø 7500 Real-Time PCR System

Ø StepOne Plus Real-Time PCR System

Ø CFX96 定量 PCR 系统

Ø Linegene 9600plus 定量 PCR 系统

n  实验所需但试剂盒中未含材料

Ø 1.5 mL 无菌离心管

Ø 96 qPCR

Ø 1000 μL100 μL10 μL 无菌低吸附带滤芯枪头

Ø DNase 及缓冲液

n  相关设

Ø 荧光定量 PCR 仪

Ø 1000 μL100 μL10 μL 移液枪

n  操作过

v  毕赤酵母  DNA 定量参考品的稀释和标准曲线的制备

毕赤酵母 DNA 定量参考品浓度标注于管壁标签上,请确认浓度后再进行稀释。 用试剂盒中提供的 DNA 稀释液将 DNA 定量参考品进行梯度稀释,稀释浓度依次为

3 ng/μL、300 pg/μL、30 pg/μL、3 pg/μL、300 fg/μL,30 fg/μL。具体操作如下:

1.      将试剂盒中的 DNA 定量参考品和 DNA 稀释液置于冰上或 2-8℃条件下融化,待完全融化后,轻弹数下混匀,短时间快速离心 3~5 s,如此重复 3 次。

2.      取 6 支干净的 1.5 mL 离心管,分别标记为 ST0,ST1,ST2,ST3,ST4,ST5。

3.      在 ST0 管中用 DNA 稀释液将 DNA 定量参考品稀释至 3 ng/μL,振荡混匀后短时间快速离心 3~5 s,重复 3 次以确保定量参考品与 DNA 稀释液充分混匀。

4.      在 ST1,ST2,ST3,ST4,ST5 管中分别加入 90 μL DNA 稀释液。

5.      按表 2 依次进行 5 次稀释操作。

image.png

已融化未使用的 DNA 稀释液可保存于 2-8℃。

若 DNA 稀释液中有析出,建议于 37℃条件下进行孵育。

标准曲线浓度点可根据实际验证结果选择,应至少有 5 个浓度点。

v  加样回收质控 ERC 的制备

根据需要设置 ERC 中的毕赤酵母 DNA 加样浓度(以制备加 30 pg 毕赤酵母 DNA量的样品 ERC 为例),具体操作如下:

1.      取 100 μL 待测样品加入 1.5 mL 干净的离心管中。

2.      再加入 10 μL ST3,混匀,标记为样品 ERC。

样品 ERC 和同批待测样品一起进行样品前处理,制备成样品 ERC 纯化液。

v  阴性质控 NCS 的制备

根据实验设置阴性质控,具体操作如下:

1.      取 100 μL DNA 稀释液加入 1.5 mL 干净的离心管中;

2.      标记为阴性质控 NCS。

阴性质控 NCS 和同批待测样品一起进行样品前处理,制备成阴性质控 NCS 纯化液。

v  qPCR 反应液(qPCR MIX)的准备和加样

1.根据所要检测的标准曲线及待测样品数量,计算所需反应孔数,一般做 3 个重复孔/样。

反应孔数=(5 个浓度梯度的标准曲线+ 1 个无模板对照 NTC+ 1 个阴性质控 NCS +待测样品×2)×3

待测样品×2 是因为我们推荐每个待测样品检测时都应同时做样品 ERC。 2.根据反应孔数计算本次所需的 qPCR MIX 总量(含有 2 孔的损失量):qPCR MIX =(反应孔数+2)× 20 μL

3.       各试剂放在冰上或 2-8℃条件下融化,并根据表 3 所示准备 qPCR MIX:

image.png

4.       上述各试剂置于冰上,轻微震荡混匀,按表 4 所示加样:

image.png

加样完成后每孔总体积为 30 μL。

image.png

该示例表示的是检测 5 个浓度梯度的 DNA 标准曲线(ST1~ST5)、1 个无模板对照 NTC、1 个阴性质控 NCS、5 个待测样品(S1~S5)和每个样品的 ERC(S1 ERC~ S5 ERC)。每个检测做 3 个重复孔。

实际检测时可根据样品多少,参照此示例进行 96 孔板排版加样。

5.       将 96 孔板用光学膜封闭,轻微震荡混匀,短时间快速离心 10 s 后放入 qPCR 仪。

v  qPCR 程序设置

² SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例。

1.    点击“实验向导”。

2.    “孔板编辑”页面中选择检测样品反应孔,选择步骤 2 项目中的“毕赤酵母残留DNA”程序;

3.    “实验运行”页面中点击“开始”运行程序。

² 其他定量 PCR 系统程序设置如下:

1.  创建空白新程序,选择绝对定量检测模板。

2.  创建新检测探针,命名为 Pichia-DNA,选择报告荧光基团为 FAM,猝灭荧光基团为 none,检测参比荧光为 ROX(可选)。

3.  设置两步法反应程序:95℃预变性 10 min;95℃ 15 s,60℃ 1 min(读取荧光), 40 个循环;反应体积 30 μL。

v  qPCR 结果分析

² SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例。

1.       “孔板编辑”页面中步骤 3:定义反应孔,将标准曲线孔的选择样品类型设置为标准品,并在标品赋值中分别根据表 2 赋值,“毕赤酵母残留 DNA”分别设为 300、30、3、 0.3、0.03,并且在相应的“样本名称”中命名为 ST1、ST2、ST3、ST4、ST5。

2.       待测样品将样品类型设置为待测样品,NTC 将样品类型设置为无模板对照。

3.       在“实验分析”页面点击image.png,可读取标准曲线的斜率、截距、相关系数、扩增效率。

4.       在“反应孔信息表中”可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值,单位为 pg/μL。

以 7500 Real-Time PCR System、软件版本 1.4 为例。

1.  在 Results 的 Amplification Plot 面板中,将 Threshold 设置为 0.02,点击 Analyze,此时可初步查看扩增曲线的形态是否正常。

2.  在 Results 的 Plate 面板中,将标准曲线孔的 Task 一栏设置为 Standard,并且在 Quantity 一栏分别赋值为 3000、300、30、3、0.3(含义为每孔的 DNA 总量,单位为 pg),并且在相应的 sample name 一栏中命名为 ST1、ST2、ST3、ST4、ST5。

3.  在 Results 的 Plate 面板中,将无模板对照 NTC 孔的 Task 一栏设置为 NTC,将阴性质控 NCS 孔、待测样品孔、样品 ERC 孔的 Task 一栏设置为 Unknown,并且在相应的 Sample Name 一栏中命名为 NTC、NCS、S、ERC,之后点击图片1.jpg

4.  在 Results 的 Standard Curve 面板中,可读取标准曲线的斜率(Slope)、截距(Intercept)、R2。

5.  在 Results 的 Report 面板中,Mean Quantity 一栏可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品、样品 ERC 的检测值,单位为 pg/10 μL。后续可在检测报告中将单位换算为 pg/μL 或 pg/mL。

根据待测样品和样品ERC 的检测结果计算加样回收率,加样回收率要求在50%~150%之间。

阴性质控 NCS 的 Ct 均值应大于标曲最低浓度 Ct 均值。

无模板对照 NTC 的检测结果应为 Undetermined 或 Ct 值≥35,或根据实验室自身验证结果设定具体标准。

上述示例结果分析的参数设置仅供参考,具体需依据实验室机型及使用的软件版本进行设定,一般也可由仪器自动判读。

 

修订日期:2023 01 16

 




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