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Human残留DNA片段分析检测试剂盒 (2G)(PCR-荧光探针法)
100测试
Cat No. 1103173
库存:现货
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产品介绍

产品信息:

• 检测类型:定量检测

• 产品规格:100测试

• 适用样品类型:对各种生物制品及药品的中间品、半成品和成品中残留的Human细胞DNA片段大小分布进行分析。

• 线性范围:3×10-2~3×102pg/μL,R2≥0.990;122bp:扩增效率为100.5%;244bp:扩增效率为100.5%;562bp:扩增效率为90.7%

• 样品回收率:50-150%

• LLOQ:3.00×10-2pg/μL

• 专属性:不受CHO、E.coli、毕赤酵母和NS0等常见工程细胞基因组DNA的干扰。

• 精密度:中间精密度及重复性实验CV值均在40%以内。

• 耐用性:至少反复冻融5次检测性能不受影响。

• 仪器适用性(包括但不限于以下设备):湖州申科SHENTEK-96S、Thermo ABI7500、Bio-Rad CFX-96、Roche LightCycler480

产品特点:

• 操作简单:搭配SHENTEK前处理设备及试剂盒,可实现自动化提取及检测。

• 灵敏度高:定量下限低至3.00×10-2pg/μL,满足实际检测需求。

• 性能稳定:试剂盒重复实验间结果稳定,均满足精密度需求。

• 质量可控:试剂盒按照药典、法规完成各项检测指标的性能验证。

质量保证:

• 建立ISO13485质量管理体系,具有完善的从研发、生产、质检的产品开发流程。

• 生产高度设备化,历史多批次生产稳定,供应链完善。

n  试剂盒简介

SHENTEK® Human 残留 DNA 片段分析检测试剂盒是用于定量分析检测各种生物制品的中间品、半成品和成品中 Human 宿主细胞 DNA 残留片段大小分布的专用试剂盒。

本试剂盒利用 PCR 荧光探针法原理,设计了四种不同的扩增片段(75 bp、122 bp、244 bp、562 bp)来定量检测分析样品中 Human 残留 DNA 片段的大小分布情况。检测快速,专一性强,性能可靠,最低检测限可以达到 fg 水平。试剂盒配套有 Human DNA 定量参考品。本试剂盒与宿主细胞残留 DNA 样本前处理试剂盒配套使用。

n  试剂盒组

image.png 

n 

4×100 Reactions。

n  有效期

规定储存条件下 24 个月,具体详见试剂盒标签。

n  适用机型(包括但不限于

Ø SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统

Ø 7500 Real-Time PCR System

Ø CFX96 定量 PCR 系统

Ø LineGene 9600 plus 定量 PCR 系统

n  实验所需但试剂盒中未含材料

Ø 1.5 mL 低吸附无菌离心管

Ø 96 qPCR

Ø 封板膜

Ø 1000 μL100 μL10 μL 无菌低吸附带滤芯枪头

n  相关设

Ø 荧光定量 PCR 仪

Ø 1000 μL100 μL10 μL 移液枪

n  操作过

v Human  DNA 定量参考品的稀释和标准曲线的制备

片段分析试剂盒中含有四种不同长度的扩增片段,在建立标曲时,需分别对不同的扩增片段设置标曲,并根据对应扩增片段的标曲来计算其残留量和分布相对量。

Human  DNA  定量参考品浓度标注于管壁标签上,请确认浓度后再进行稀释。

用试剂盒中提供的 DNA 稀释液将 Human DNA 定量参考品进行梯度稀释,稀释浓度依次为 3 ng/μL、300 pg/μL、30 pg/μL、3 pg/μL、300 fg/μL,30 fg/μL。具体操作如下:

1.将试剂盒中的 Human DNA 定量参考品和 DNA 稀释液置于冰上或 2-8 ℃条件下融化,待完全融化后,轻弹数下混匀,短时间快速离心 3-5 s,如此重复 3 次。

2.    取 6 支干净的 1.5 mL 离心管,分别标记为 ST0,ST1,ST2,ST3,ST4,ST5。

3.    在 ST0 管中用 DNA 稀释液将 Human DNA 定量参考品稀释至 3 ng/μL,振荡混匀后短时间快速离心 3-5 s,重复 3 次以确保定量参考品与 DNA 稀释液充分混匀。

4.    在 ST1,ST2,ST3,ST4,ST5 管中分别加入 180 μL DNA 稀释液。

5.    按表 2 依次进行 5 次稀释操作。

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已融化未使用的 DNA 稀释液可保存于 2-8 ℃。

若 DNA 稀释液中有析出,建议于 37 ℃条件下进行孵育。

标准曲线浓度点可根据实际验证结果选择,应至少有 5 个浓度点。

v 阴性质控 NCS 的制备

1. 取 100 μL DNA 稀释液加入 1.5 mL 干净的离心管中,标记为阴性质控 NCS。

阴性质控 NCS 和同批待测样品一起进行样品前处理,制备成阴性质控 NCS 纯化液。

v qPCR 反应液(qPCR MIX)的准备

1.       根据所要检测的标准曲线及待测样品数量,计算所需反应孔数,一般做 3 个重复孔/样。

反应孔数=(5 个浓度梯度的标准曲线+1 个无模板对照 NTC+1 个阴性质控 NCS +待测样品)× 3

2.       根据反应孔数计算本次所需的 qPCR MIX 总量(含有 2 孔的损失量):

qPCR MIX =(反应孔数+2)× 20 μL

3.       各试剂放在冰上或 2-8 ℃条件下融化,并参考表 3、4、5、6 所示准备对应扩增片段的 qPCR MIX:

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为满足同步进行四种扩增片段检测,DNA 模板需≥120 μL,建议每个样品同时准备 2 管进行前处理,提取完成后混匀使用。

v  加样

  1.        各试剂置于冰上,轻微振荡混匀,选择对应扩增片段参考表 7、8、9、10 所示加样:

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加样完成后每孔总体积为 30 μL。

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该示例表示的是检测各浓度梯度的 DNA 标准曲线、1 个无模板对照 NTC、1 个阴性质控 NCS、1 个待测样品。每个检测做 3 个重复孔。其中 1-3 列为 qPCR MIX-75, 4-6 列为 qPCR MIX-122,7-9 列为 qPCR MIX-244,10-12 列为 qPCR MIX-562。

实际检测时可根据样品多少,参照此示例进行 96 孔板排版加样。

2.       将 96 孔板用光学膜封闭,轻微震荡混匀,短时间快速离心 10 s 后放入 qPCR 仪。

v  qPCR 程序设置

²  SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例。

1.    点击实验向导

2.    孔板编辑页面中选择检测 Human-75 反应孔,选择步骤 2 项目中的“Human SIZE-75 bp”程序;选择检测 Human-122 反应孔,选择步骤 2 项目中的“Human SIZE-122 bp”程序;选择检测 Human-244 反应孔,选择步骤 2 项目中的“Human SIZE-244 bp”序;选择检测 Human-562 反应孔,选择步骤 2 项目中的“Human SIZE-562 bp”程序。

3.    实验运行页面中点击开始运行程序。

²  其他定量 PCR 系统程序设置如下:

1.    创建空白新程序,选择绝对定量检测模板。

2.    四组 qPCR MIX 创建新检测探针,分别为命名为 qPCR MIX-75qPCR MIX-122qPCR MIX-244qPCR MIX-562,选择报告荧光基团为 FAM,猝灭荧光基团为 none;创建新检测探针,命名为 IPC,选择报告荧光基团为 VIC,猝灭荧光基团为 none;检测参比荧光为 ROX(可选)。

3. 设置三步法反应程序: 95预变10 min 9515 s 6030 s 721 min 30 s,(读取荧光),40 个循环;反应体积 30 μL 

各实验室可根据所用机型设置合理的反应程序。

v qPCR 结果分析

² 以 SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例。

1.       孔板编辑页面中步骤 3:定义反应孔,将标准曲线孔的选择样品类型设置为标准品,并进行赋值。“Human SIZE-75 bpHuman SIZE-122 bpHuman SIZE-244 bp Human SIZE-562 bp”设为 3003030.30.03,并在相应的样本名称中命名为 ST1ST2ST3ST4ST5

2.       待测样品将样品类型设置为待测样品,NTC 将样品类型设置为无模板对照。

3.       实验分析页面点击image.png,可读取标准曲线的斜率、截距、相关系数、扩增效率。

4.       反应孔信息表中可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值,单位为 pg/μL

² 7500 Real-Time PCR System、软件版本 1.4 为例。

1.       Results Amplification Plot 面板中,Human-75 Threshold 设置为 0.04Human-122Human-244Human-562 Threshold 设置为 0.02,点击 Analyze,此时可初步查看扩增曲线的形态是否正常。

2.       Results Plate 面板中,将标准曲线孔的 Task 一栏设置为 Standard,并且在 Quantity 一栏分别赋值为 3003030.30.03含义为每孔的模板浓度,单位为 pg/μL并且在相应的 Sample Name 一栏中命名为 ST1ST2ST3ST4ST5

3.       Results Plate 面板中,将无模板对照 NTC 孔的 Task 一栏设置为 NTC,将阴性质控 NCS 孔、待测样品孔的 Task 一栏设置为 Unknown,并且在相应的 Sample Name一栏中命名为 NTCNCSS,之后点击图片1.jpg

4.       Results Standard Curve 面板中,可读取各标准曲线的斜率(Slope、截距Intercept)、R2

5.       Results Report 面板中,Mean Quantity 一栏可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值,单位为 pg/μL

6.       MIX-75 的待测样品检测值为 100%,计算 MIX-122MIX-244MIX-562 的待测样品百分比。

7.       待测样品的Ct-IPC 均值与NCS Ct-IPC 均值在±1 Ct 值范围内。若样品 Ct-IPC均值与 NCS Ct-IPC 均值相比明显增大,则表明样品可能有抑制。如同时测试加标样品,则优先考虑样品回收率结果,IPC 结果作为参考。

8.       阴性质控 NCS、无模板对照 NTC FAM 信号的 Ct 值应大于标曲最低浓度 FAM Ct 值。VIC 信号为有效的“S”型扩增曲线。

上述示例结果分析的参数设置仅供参考,具体需依据实验室机型及使用的软件版本进行设定,一般也可由仪器自动判读。

 

修订日期:2023 02 27

 

 


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