产品信息:
• 检测类型:定量检测
• 产品规格:100测试
• 适用样品类型:对各种生物制品及药品的中间品、半成品和成品中残留的Human细胞DNA片段大小分布进行分析。
• 线性范围:3×10-2~3×102pg/μL,R2≥0.990;122bp:扩增效率为100.5%;244bp:扩增效率为100.5%;562bp:扩增效率为90.7%
• 样品回收率:50-150%
• LLOQ:3.00×10-2pg/μL
• 专属性:不受CHO、E.coli、毕赤酵母和NS0等常见工程细胞基因组DNA的干扰。
• 精密度:中间精密度及重复性实验CV值均在40%以内。
• 耐用性:至少反复冻融5次检测性能不受影响。
• 仪器适用性(包括但不限于以下设备):湖州申科SHENTEK-96S、Thermo ABI7500、Bio-Rad CFX-96、Roche LightCycler480
产品特点:
• 操作简单:搭配SHENTEK前处理设备及试剂盒,可实现自动化提取及检测。
• 灵敏度高:定量下限低至3.00×10-2pg/μL,满足实际检测需求。
• 性能稳定:试剂盒重复实验间结果稳定,均满足精密度需求。
• 质量可控:试剂盒按照药典、法规完成各项检测指标的性能验证。
质量保证:
• 建立ISO13485质量管理体系,具有完善的从研发、生产、质检的产品开发流程。
• 生产高度设备化,历史多批次生产稳定,供应链完善。
SHENTEK® Human 残留 DNA 片段分析检测试剂盒是用于定量分析检测各种生物制品的中间品、半成品和成品中 Human 宿主细胞 DNA 残留片段大小分布的专用试剂盒。
本试剂盒利用 PCR 荧光探针法原理,设计了四种不同的扩增片段(75 bp、122 bp、244 bp、562 bp)来定量检测分析样品中 Human 残留 DNA 片段的大小分布情况。检测快速,专一性强,性能可靠,最低检测限可以达到 fg 水平。试剂盒配套有 Human DNA 定量参考品。本试剂盒与宿主细胞残留 DNA 样本前处理试剂盒配套使用。
4×100 Reactions。
规定储存条件下 24 个月,具体详见试剂盒标签。
Ø SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统
Ø 7500 Real-Time PCR System
Ø CFX96 定量 PCR 系统
Ø LineGene 9600 plus 定量 PCR 系统
Ø 1.5 mL 低吸附无菌离心管
Ø 96 孔 qPCR 板
Ø 封板膜
Ø 1000 μL,100 μL,10 μL 无菌低吸附带滤芯枪头
Ø 荧光定量 PCR 仪
Ø 1000 μL,100 μL,10 μL 移液枪
v Human DNA 定量参考品的稀释和标准曲线的制备
片段分析试剂盒中含有四种不同长度的扩增片段,在建立标曲时,需分别对不同的扩增片段设置标曲,并根据对应扩增片段的标曲来计算其残留量和分布相对量。
用试剂盒中提供的 DNA 稀释液将 Human DNA 定量参考品进行梯度稀释,稀释浓度依次为 3 ng/μL、300 pg/μL、30 pg/μL、3 pg/μL、300 fg/μL,30 fg/μL。具体操作如下:
1.将试剂盒中的 Human DNA 定量参考品和 DNA 稀释液置于冰上或 2-8 ℃条件下融化,待完全融化后,轻弹数下混匀,短时间快速离心 3-5 s,如此重复 3 次。
2. 取 6 支干净的 1.5 mL 离心管,分别标记为 ST0,ST1,ST2,ST3,ST4,ST5。
3. 在 ST0 管中用 DNA 稀释液将 Human DNA 定量参考品稀释至 3 ng/μL,振荡混匀后短时间快速离心 3-5 s,重复 3 次以确保定量参考品与 DNA 稀释液充分混匀。
4. 在 ST1,ST2,ST3,ST4,ST5 管中分别加入 180 μL DNA 稀释液。
5. 按表 2 依次进行 5 次稀释操作。
已融化未使用的 DNA 稀释液可保存于 2-8 ℃。
若 DNA 稀释液中有析出,建议于 37 ℃条件下进行孵育。
标准曲线浓度点可根据实际验证结果选择,应至少有 5 个浓度点。
1. 取 100 μL DNA 稀释液加入 1.5 mL 干净的离心管中,标记为阴性质控 NCS。
阴性质控 NCS 和同批待测样品一起进行样品前处理,制备成阴性质控 NCS 纯化液。
1. 根据所要检测的标准曲线及待测样品数量,计算所需反应孔数,一般做 3 个重复孔/样。
2. 根据反应孔数计算本次所需的 qPCR MIX 总量(含有 2 孔的损失量):
3. 各试剂放在冰上或 2-8 ℃条件下融化,并参考表 3、4、5、6 所示准备对应扩增片段的 qPCR MIX:
为满足同步进行四种扩增片段检测,DNA 模板需≥120 μL,建议每个样品同时准备 2 管进行前处理,提取完成后混匀使用。
各试剂置于冰上,轻微振荡混匀,选择对应扩增片段参考表 7、8、9、10 所示加样:
加样完成后每孔总体积为 30 μL。
该示例表示的是检测各浓度梯度的 DNA 标准曲线、1 个无模板对照 NTC、1 个阴性质控 NCS、1 个待测样品。每个检测做 3 个重复孔。其中 1-3 列为 qPCR MIX-75, 4-6 列为 qPCR MIX-122,7-9 列为 qPCR MIX-244,10-12 列为 qPCR MIX-562。
实际检测时可根据样品多少,参照此示例进行 96 孔板排版加样。
2. 将 96 孔板用光学膜封闭,轻微震荡混匀,短时间快速离心 10 s 后放入 qPCR 仪。
² SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例。
1. 点击“实验向导”。
2. “孔板编辑”页面中选择检测 Human-75 反应孔,选择步骤 2 项目中的“Human SIZE-75 bp”程序;选择检测 Human-122 反应孔,选择步骤 2 项目中的“Human SIZE-122 bp”程序;选择检测 Human-244 反应孔,选择步骤 2 项目中的“Human SIZE-244 bp”程序;选择检测 Human-562 反应孔,选择步骤 2 项目中的“Human SIZE-562 bp”程序。
3. “实验运行”页面中点击“开始”运行程序。
² 其他定量 PCR 系统程序设置如下:
1. 创建空白新程序,选择绝对定量检测模板。
2. 四组 qPCR MIX 创建新检测探针,分别为命名为 qPCR MIX-75、qPCR MIX-122、 qPCR MIX-244、qPCR MIX-562,选择报告荧光基团为 FAM,猝灭荧光基团为 none;创建新检测探针,命名为 IPC,选择报告荧光基团为 VIC,猝灭荧光基团为 none;检测参比荧光为 ROX(可选)。
3. 设置三步法反应程序: 95 ℃ 预变性 10 min ; 95 ℃ 15 s , 60 ℃ 30 s ,72 ℃ 1 min 30 s,(读取荧光),40 个循环;反应体积 30 μL。
各实验室可根据所用机型设置合理的反应程序。
² 以 SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例。
1. “孔板编辑”页面中步骤 3:定义反应孔,将标准曲线孔的选择样品类型设置为标准品,并进行赋值。“Human SIZE-75 bp、Human SIZE-122 bp、Human SIZE-244 bp 和 Human SIZE-562 bp”设为 300、30、3、0.3,0.03,并在相应的“样本名称”中命名为 ST1、 ST2、ST3、ST4、ST5。
2. 待测样品将样品类型设置为待测样品,NTC 将样品类型设置为无模板对照。
3. 在“实验分析”页面点击,可读取标准曲线的斜率、截距、相关系数、扩增效率。
4. 在“反应孔信息表中”可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值,单位为 pg/μL。
² 以 7500 Real-Time PCR System、软件版本 1.4 为例。
1. 在 Results 的 Amplification Plot 面板中,Human-75 将 Threshold 设置为 0.04, Human-122、Human-244、Human-562 将 Threshold 设置为 0.02,点击 Analyze,此时可初步查看扩增曲线的形态是否正常。
2. 在 Results 的 Plate 面板中,将标准曲线孔的 Task 一栏设置为 Standard,并且在 Quantity 一栏分别赋值为 300、30、3、0.3、0.03(含义为每孔的模板浓度,单位为 pg/μL),并且在相应的 Sample Name 一栏中命名为 ST1、ST2、ST3、ST4、ST5。
3. 在 Results 的 Plate 面板中,将无模板对照 NTC 孔的 Task 一栏设置为 NTC,将阴性质控 NCS 孔、待测样品孔的 Task 一栏设置为 Unknown,并且在相应的 Sample Name一栏中命名为 NTC、NCS、S,之后点击。
4. 在 Results 的 Standard Curve 面板中,可读取各标准曲线的斜率(Slope)、截距(Intercept)、R2。
5. 在 Results 的 Report 面板中,Mean Quantity 一栏可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值,单位为 pg/μL。
6. 以 MIX-75 的待测样品检测值为 100%,计算 MIX-122、MIX-244、MIX-562 的待测样品百分比。
7. 待测样品的Ct-IPC 均值与NCS 的Ct-IPC 均值在±1 个Ct 值范围内。若样品 Ct-IPC均值与 NCS Ct-IPC 均值相比明显增大,则表明样品可能有抑制。如同时测试加标样品,则优先考虑样品回收率结果,IPC 结果作为参考。
8. 阴性质控 NCS、无模板对照 NTC FAM 信号的 Ct 值应大于标曲最低浓度 FAM 信号 Ct 值。VIC 信号为有效的“S”型扩增曲线。
上述示例结果分析的参数设置仅供参考,具体需依据实验室机型及使用的软件版本进行设定,一般也可由仪器自动判读。
修订日期:2023 年 02 月 27 日
400-829-0116