产品信息:
• 检测类型:定量检测
• 产品规格:100测试
• 适用样品类型:对各种生物制品及药品的中间品、半成品和成品中残留的Vero细胞DNA片段大小分布进行分析。
• 线性范围:85bp(3×10-2~3×102pg/μL,R2≥0.990,扩增效率为96.7%);134bp(3×10-2~3×102pg/μL,R2≥0.990,扩增效率为96.4%);229bp(3×10-2~3×102pg/μL,R2≥0.990,扩增效率为91.8%);552bp(3×10-2~3×102pg/μL,R2≥0.990,扩增效率为92.8%)
• 样品回收率:50-150%
• LLOQ:3.00×10-2pg/μL
• 专属性:不受CHO、E.coli、MDCK和毕赤酵母等常见工程细胞基因组DNA的干扰。
• 精密度:中间精密度及重复性实验CV值均在40%以内。
• 耐用性:至少反复冻融5次检测性能不受影响。
• 仪器适用性(包括但不限于以下设备):湖州申科SHENTEK-96S、Thermo ABI7500、Bio-Rad CFX-96、Roche LightCycler480、耶拿qTOWER3
产品特点:
• 操作简单:搭配SHENTEK前处理设备及试剂盒,可实现自动化提取及检测。
• 灵敏度高:定量下限低至3.00×10-2pg/μL,满足实际检测需求。
• 性能稳定:试剂盒重复实验间结果稳定,均满足精密度需求。
• 质量可控:试剂盒按照药典、法规完成各项检测指标的性能验证。
质量保证:
• 建立ISO13485质量管理体系,具有完善的从研发、生产、质检的产品开发流程。
• 生产高度设备化,历史多批次生产稳定,供应链完善
n 试剂盒简介
SHENTEK® Vero 残留 DNA 片段分析检测试剂盒(2G)是用于定量分析检测各种生物制品的中间品、半成品和成品中 Vero 宿主细胞 DNA 残留片段大小分布的专用试剂盒。
本试剂盒利用 PCR 荧光探针法原理,设计了四种不同的扩增片段(85 bp、134 bp、 229 bp、552 bp)来定量检测分析样品中 Vero 残留 DNA 片段的大小分布情况。检测快速,专一性强,性能可靠,最低检测限可以达到 fg 水平。试剂盒配套有 Vero DNA 定量参考品。本试剂盒与宿主细胞残留 DNA 样本前处理试剂盒配套使用。
n 试剂盒组分
n 规格
4×100 Reactions。
规定储存条件下 24 个月,具体详见试剂盒标签。
Ø SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统
Ø 7500 Real-Time PCR System
Ø CFX96 定量 PCR 系统
Ø LineGene 9600plus 定量 PCR 系统
Ø 1.5 mL 无菌离心管
Ø 96 孔 qPCR 板
Ø 1000 μL,100 μL,10 μL 无菌低吸附带滤芯枪头
Ø 荧光定量 PCR 仪
Ø 1000 μL,100 μL,10 μL 移液枪
v Vero DNA 定量参考品的稀释和标准曲线的制备
注:片段分析试剂盒中含有四种不同长度的扩增片段,在建立标曲时,需分别对不同的扩增片段设置标曲,并根据对应扩增片段的标曲来计算其残留量和分布相对量。
Vero DNA 定量参考品浓度标注于管壁标签上,请确认浓度后再进行稀释。
用试剂盒中提供的 DNA 稀释液将 Vero DNA 定量参考品进行梯度稀释,稀释浓度依次为 3 ng/μL、300 pg/μL、30 pg/μL、3 pg/μL、300 fg/μL,30 fg/μL。具体操作如下:
1. 将试剂盒中的 Vero DNA 定量参考品和 DNA 稀释液置于冰上或 2-8℃条件下融化。待完全融化后,轻弹数下混匀,短时间快速离心 3~5 s,如此重复 3 次。
2. 取 6 支干净的 1.5 mL 离心管,分别标记为 ST0,ST1,ST2,ST3,ST4,ST5。
3. 在 ST0 管中用 DNA 稀释液将 Vero DNA 定量参考品稀释至 3 ng/μL,振荡混匀后短时间快速离心 3~5 s,重复 3 次以确保定量参考品与 DNA 稀释液充分混匀。
4. 在 ST1,ST2,ST3,ST4,ST5 管中分别加入 180 μL DNA 稀释液。
5. 按表 2 依次进行 5 次稀释操作。
已融化未使用的 DNA 稀释液可保存于 2-8℃。
若 DNA 稀释液中有析出,建议于 37℃条件下进行孵育。
标准曲线浓度点可根据实际验证结果选择,应至少有 5 个浓度点。
根据实验设置阴性质控,具体操作如下:
1.取 100 μL DNA 稀释液加入至 1.5 mL 干净的离心管中,标记为阴性质控 NCS。 阴性质控 NCS 和同批待测样品一起进行样品前处理,制备成阴性质控 NCS 纯化
液。
1. 根据所要检测的标准曲线及待测样品数量,计算所需反应孔数,一般做 3 个重复孔/样。
2. 根据反应孔数计算本次所需的 qPCR MIX 总量(含有 2 孔的损失量):
3. 各试剂放在冰上或 2-8℃条件下融化,并参考表 3、4、5、6 所示准备对应扩增片段的 qPCR MIX:
为了满足同步进行四个不同扩增长度的片段分析检测需求,样品前处理中的DNA 洗脱体积需要≥120 μL。
1. 各试剂置于冰上,轻微振荡混匀,选择对应扩增片段参考表 7、8、9、10 所示加样:
加样完成后每孔总体积为 30 μL。
该示例表示的是检测各浓度梯度的 DNA 标准曲线、1 个无模板对照 NTC、1 个阴性质控 NCS、1 个待测样品。每个检测做 3 个重复孔。其中 1~3 列为 qPCR MIX-85, 4~6 列为 qPCR MIX-134,7~9 列为 qPCR MIX-229,10~12 列为 qPCR MIX-552。
实际检测时可根据样品多少,参照此示例进行 96 孔板排版加样。
2. 将 96 孔板用光学膜封闭,轻微震荡混匀,短时间快速离心 10 s 后放入 qPCR 仪。
2. “孔板编辑”页面中选择检测 Vero-85 反应孔,选择步骤 2 项目中的“Vero SIZE-85 bp”程序;选择检测 Vero-134 反应孔,选择步骤 2 项目中的“Vero SIZE-134 bp”程序;选择检测 Vero-229 反应孔, 选择步骤 2 项目中的“Vero SIZE-229 bp” 程序; 选择检测 Vero-552 反应孔,选择步骤 2 项目中的“Vero SIZE-552 bp”程序。
3. “实验运行”页面中点击“开始”运行程序。
其他定量 PCR 系统程序设置如下:
1. 创建空白新程序,选择绝对定量检测模板。
2. 四组 qPCR MIX 创建新检测探针,分别为命名为 Vero-85、Vero-134、Vero-229、 Vero-552,选择报告荧光基团为 FAM,猝灭荧光基团为 none;创建新检测探针,命名为 IPC,选择报告荧光基团为 VIC,猝灭荧光基团为 none;检测参比荧光为 ROX(可选)。
3.设置三步法反应程序:95℃预变性 10 min;95℃ 15 s,60℃ 30 s,72℃ 1 min 30 s(读取荧光),40 个循环;反应体积 30 μL。
各实验室可根据所用机型设置合理的反应程序。
1. “孔板编辑”页面中步骤 3:定义反应孔,将标准曲线孔的选择样品类型设置为标准品,并进行赋值。“Vero SIZE-85 bp、Vero SIZE-134 bp、Vero SIZE-229 bp、Vero SIZE-552 bp”设为 300、30、3、0.3,0.03,并在相应的“样本名称”中命名为 ST1、ST2、ST3、ST4、 ST5。
2. 待测样品将样品类型设置为待测样品,NTC 将样品类型设置为无模板对照。
3. 在“实验分析”页面点击,可读取标准曲线的斜率、截距、相关系数、扩增效率。
4. 在“反应孔信息表中”可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值,单位为 pg/μL。
² 以 7500 Real-Time PCR System、软件版本 1.4 为例。
1. 在 Results 的 Amplification Plot 面板中,将 Threshold 设置为 0.02,点击 Analyze,此时可初步查看扩增曲线的形态是否正常。
2. 在 Results 的 Plate 面板中,将标准曲线孔的 Task 一栏设置为 Standard,并且在 Quantity 一栏分别赋值为 300、30、3、0.3、0.03(含义为每孔的模板浓度,单位为 pg/μL),并且在相应的 Sample Name 一栏中命名为 ST1、ST2、ST3、ST4、ST5。
3. 在 Results 的 Plate 面板中,将无模板对照 NTC 孔的 Task 一栏设置为 NTC,将阴性质控 NCS 孔、待测样品孔的 Task 一栏设置为 Unknown,并且在相应的 Sample Name
一栏中命名为 NTC、NCS、S,之后点击。
4. 在 Results 的 Standard Curve 面板中,可读取各标准曲线的斜率(Slope)、截距(Intercept)、R2。
5. 在 Results 的 Report 面板中,Mean Quantity 一栏可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值,单位为 pg/μL。
6. 以 MIX-85 的待测样品检测值为 100%,计算 MIX-134、MIX-229、MIX-552 的待测样品百分比。
7. 建议同时测试加标样品,以样品回收率结果作为判定标准。IPC 结果受基质影响大,建议各实验室根据验证结果统计分析,确定 IPC 标准。
8. NTC 的检测结果应为 Undetermined 或 Ct 值≥35,或根据实验室自身验证结果设定具体标准。NCS 的 Ct 均值应大于标曲最低浓度 Ct 均值,若经验证的定量限浓度低于标曲最低浓度,则 NCS 的检测值应小于定量限浓度。
结果分析的参数设置需依据具体的机型及使用的软件版本,一般也可由仪器自动判读。CFX96 型号定量PCR 仪,软件版本CFX Manager 2.0,阈值线可设置为300;LineGene 9600plus 定量 PCR 仪,软件版本 FQD-96a V1.0.02,阈值线可设置为 600。
修订日期:2023 年 01 月 16 日
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