本试剂盒用于提取纯化生物样品中的微量真菌&细菌DNA,适用样品包括主细胞库、工作细胞库等细胞培养物,疫苗、细胞治疗产品等生物制品,同时对高浓度细胞(不大于106 个细胞)类复杂基质生物制品均适用。该产品与MicroSHENTEK® 细菌DNA检测试剂盒(PCR-荧光探针法)和MicroSHENTEK® 真菌DNA检测试剂盒(PCR-荧光探针法)配套使用。试剂盒参照中国药典qPCR方法检测相关要求进行验证,若使用推荐的体系提取性能可达50-100 CFU/管,搭配对应检测试剂盒检测限不大于35 CFU/反应。
本试剂盒通过rHCD purify®前处理系统实现样品的自动化处理。
MicroSHENTEK® 真菌&细菌 DNA 提取纯化试剂盒(磁珠法)用于提取纯化生物样品中的微量真菌&细菌 DNA,适用样品包括主细胞库、工作细胞库等细胞培养物,疫苗、细胞治疗产品等生物制品,同时对高浓度细胞(不大于 106 个细胞)类复杂基质生物制品均适用。该产品与 MicroSHENTEK® 细菌 DNA 检测试剂盒(PCR-荧光探针法)和 MicroSHENTEK® 真菌 DNA 检测试剂盒(PCR-荧光探针法)配套使用。试剂盒参照中国药典 qPCR 方法检测相关要求进行验证,若使用推荐的体系提取性能可达 50-100 CFU/管,搭配对应检测试剂盒检测限不大于 35 CFU/反应。
本试剂盒通过 rHCD purify®前处理系统实现样品的自动化处理。
n 试剂盒组分
n 规格
50 Extractions
规定储存条件下 24 个月,具体详见试剂盒标签。
Ø 无菌超纯水
Ø 无水乙醇(分析纯)
Ø 100%异丙醇(分析纯)
Ø 75%酒精
Ø 1000 μL,200 μL,100 μL,10 μL 无菌低吸附滤芯枪头
Ø 1.5 mL,2.0 mL,50 mL 无菌低吸附离心管
Ø 真菌&细菌阳性菌株
Ø 医疗用一次性利器盒
Ø 核酸清除剂,联系本公司订购
Ø 真菌细菌破壁仪(Lyse-S)
Ø 单人桌面无菌超净工作台(SSD-1)
Ø rHCDpurify®前处理系统
Ø 迷你离心机
Ø 高速离心机
Ø 漩涡振荡器
Ø 恒温金属浴
Ø 1000 μL,200 μL,100 μL,10 μL 移液枪
根据样品类型进行分区:分为阴性区、待测样品区、阳性区。分别在各区域单人桌面无菌超净工作台(SSD-1)中操作
阴性区:NCS 阴性质控处理加样区域&试剂加样区域;待测样品区:待测样品处理加样区域;
阳性区:PCS 阳性质控处理加样区域。
工作区及环境进行适当地消毒,去除残留核酸。至少使用核酸清除剂、75%酒精进行全方位擦拭消毒处理各区域超净工作台。
打开超净工作台紫外灯灭菌,保证照射时长不少于 1 小时;并打开各区域紫外设施灭菌,保证照射时长不少于 30 分钟。
注意:所有试剂稀释和加样均在阴性区操作!
Ø 根据使用体积将助沉剂Ⅰ用稀释液按 10 倍梯度稀释 100 倍,备用。
Ø 在新开启的洗涤液A 中加入 20 mL 的无水乙醇。
Ø 准备好 100%的异丙醇。
Ø 在干净的试剂瓶中用无水乙醇和灭菌超纯水配制 70%乙醇溶液,标记为洗涤液 B。
Ø 配制后的洗涤液应密封,室温保存,防止乙醇挥发(注意使用效期)。
Ø 使用前若发现裂解液、结合液出现结晶或沉淀,应 37 ℃水浴,待完全溶解后,振荡混匀。
Ø 使用前应提前将磁珠置于室温环境下平衡 10 分钟,使用前涡旋振荡 10 秒混匀。
Ø 开启恒温金属浴,设置温度为 55 ℃。
Ø 真菌细菌破壁仪:分别用核酸清除剂、75%酒精进行全方位擦拭消毒处理。
Ø 前处理提取仪:电源键打开—点击“登录”输入账号及密码—进入主界面。分别用核酸清除剂、75%酒精进行全方位擦拭消毒处理。处理后可提前插入塑料套管,紫外灭菌不少于 1 小时。
备注:若用户样品为细胞基质,首先采用70-75 ×g,5 分钟离心处理,离心后吸取上清按照上述步骤操作。
样品处理的详细步骤如下:
1)将样品等分为 2 份,1 份用于细菌提取,1 份用于真菌提取。分别采用 ≥16200×g,4 ℃离心 15-30 分钟,使用移液器移去上清,使剩余体积为 40-80 μL,后加入 400 μL 稀释液涡旋振荡混匀。
备注:离心时间的长短由样品初始体积决定,样品体积≥500 μL,推荐使用30 分钟离心。
1) 将上述样品转移至样品处理管中。
2) 加入 5 μL 稀释后的助沉剂Ⅰ。
3) 用于真菌提取的样品加入 10 μL Fun 内部质控(IC)。
备注:Fun 内部质控(IC)试剂为MicroSHENTEK® 真菌DNA 检测试剂盒(PCR-荧光探针法)中组分。
1) 将样品处理管按照真菌细菌破壁仪(Lyse-S)说明书要求对称放置于仪器上,拧紧压盖螺母,关闭顶盖直至自动扣紧。
2) 选择自定义参数设置界面,根据提示设置速度、时间、循环数。推荐设置参数:5 米/秒,40 秒,1 循环条件下振荡处理。
1) 将处理好的样品处理管于 ≥16200 ×g,4 ℃离心 ≥2 分钟,确保离心后的管内液体全部离心到底部,液面位置无明显泡沫存在。
2) 离心后将样品上清液在对应操作区全部吸出,并转移至新的 1.5 mL 离心管(避免吸到底部白色颗粒)。
Ø 阴性对照样品(NCS)
取与待测样品体积一致的稀释液,按照上述样品处理步骤进行处理。
取真菌和细菌阳性菌株,分别加入稀释液或样品基质,推荐加入待测样品作为基质(总体积与待测样品体积保持一致),按照上述样品处理步骤进行处理。
在所有样品中,加入 10 μL 5M NaCl、10 μL 蛋白酶 K、100 μL 裂解液,振荡混匀后,55 ℃孵育 40-60 分钟。
注意:为了使样品消化更加完全,推荐孵育至20-30 分钟左右时再次进行涡旋振荡混匀后继续孵育。总孵育时长请根据样品及基质情况在推荐范围内确定。样品消化后需尽快进行下述的DNA 提取实验!
操作过程(rHCDpurify®前处理系统)
预先准备两块 96 深孔板,并按照下述排布加入相应溶液:待测样品和 NCS 排布示意图(96 深孔板-1)
其中:
第 1 或 7 列:结合液 200 μL/孔,异丙醇 200-400 μL/孔,助沉剂 II 9 μL/孔,消化后的全部样品
第 2 或 8 列:洗涤液A 700 μL/孔
第 3 或 9 列:洗涤液B 700 μL/孔
第 4 或 10 列:磁珠 30 μL/孔
第 5 或 11 列:洗脱液 65 μL/孔
备注:PCS 样品和其他样品推荐按照上述排布示意图分别置于两块96 深孔板上进行提取。上述待测样品、NCS 和PCS 尾缀“-细菌”表示提取对应样品中的细菌;尾缀“-真菌”表示提取对应样品中的真菌。
1. 将加好样的 96 深孔板快速放入仪器中固定位置(96 深孔板-1 放置仪器最右侧,96 深孔板-2 放置仪器最左侧),确认塑料套管已插入磁棒对应位置。
2. 点击“运行”—选择“Micro-633”程序—扫描试剂盒上二维码—仪器运行约 52 分钟。
3. 程序结束,发出“嘀嘀”声,立即取出深孔板,将样品纯化液按照样品类型全部转移到新的离心管内。
1. 根据样品类型按照要求进行严格分区操作,每个区域配备独立的设备、试剂及耗材,不得交叉使用。实验试剂、待测样品、PCR 产物应分开存放,不应放于同处。减少在实验区内不必要的走动,以降低污染发生概率。
2. 实验过程中选择最合适尺寸的手套并及时更换,在不同实验区域或进行模板操作后都应更换实验服、口罩、帽子及手套,以避免不同实验区域交叉污染。
3. 实验开始前确保实验室环境温度不低于 22 ℃,湿度不高于 70%。
4. 程序启动前,检查 96 深孔板和套管是否固定好。
5. 程序运行完毕后,需立即取出 96 深孔板并将洗脱液转移至新的离心管。96 深孔板第 5 或第 11 列壁上可能会出现冷凝水珠,该现象不会影响提取效果,只需将底部洗脱液转移出来即可,且保证多于 40 μL,确保检测时所需。
6. 建议完成样品纯化处理当天进行后续的 qPCR 检测,确保检测结果准确。
修订日期:2025 年 05 月 23 日
生效日期:2025 年 05 月 23 日
400-829-0116