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REO-3病毒核酸检测试剂盒 (RT-PCR 荧光探针法)
Cat No. 1506733
库存:现货
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产品介绍

本试剂盒与SHENTEK®病毒核酸提取试剂盒(磁珠法)配套使用,用于检测呼肠孤病毒3型(Reovirus 3,REO-3)。适用于生物制品中对细胞库,病毒种子批和牛血清中的REO-3病毒污染进行快速检测。

n  试剂盒简介

SHENTEK® REO-3 病毒核酸检测试剂盒(RT-PCR 荧光探针法)与 SHENTEK® 病毒核酸提取试剂盒(磁珠法)配套使用,用于检测呼肠孤病毒 3 型(Reovirus 3,REO-3)。适用于生物制品中对细胞库,病毒种子批和牛血清中的 REO-3 病毒污染进行快速检测。

本试剂盒利用荧光探针法 RT-qPCR 技术,检测灵敏度高,最低检测限达到 50 copies/反应。检测特异性强,与牛源病毒(BVDV、PI-3、BAV-3、BPV),工程细胞(CHO、 VERO、293T、MDCK、NS0、Sf9),工程菌(大肠杆菌、毕赤酵母)和牛、猪基因组无交叉反应干扰。

n  试剂盒组分

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n  规格

50 Reactions。

n  有效期

规定储存条件下 24 个月,具体详见试剂盒标签。

n   适用机型(包括但不限于以下机型,使用前需验证检测灵敏度)

1.        SHENTEK-96S 定量 PCR 系统

2.        7500 Real-Time PCR System

3.        CFX96 定量 PCR 系统

4.        Roche LightCycler 480 Ⅱ

n   实验所需但试剂盒中未含材料

1.        1.5 mL 或 2.0 mL 无菌 DNase/RNase-free 低吸附离心管

2.        96 孔 qPCR 板或八联管

3.        1000 μL,200 μL,100 μL,10 μL DNase/RNase-free 低吸附带滤芯枪头

4.        病毒核酸提取试剂盒(货号:1506730)

5.        REO-3  阳性对照品,联系本公司订购

n   相关设备

1.        生物安全柜

2.        迷你离心机

3.        漩涡振荡器

4.        荧光定量 PCR 仪

5.        1000 μL,200 μL,100 μL,10 μL 移液枪

 

n  实验操作流程

 

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图 1 操作流程示意图

 

一、试剂、仪器准备

(一)实验前准备:

1.         穿戴实验服、一次性乳胶手套、一次性无纺布帽子。

2.        有感染性病毒提取检测和有感染性病毒阳性对照品处理建议在P2 实验室和生物安全柜中进行。

3.        检测过程中严格使用无核酶的试剂和耗材。

4.        需要使用的试剂提前取出置于冰上融解并充分混匀。

(二)病毒核酸提取:

l 待测样品的病毒核酸提取

1.    使用病毒核酸提取试剂盒(货号:1506730)对样品中的病毒核酸提取纯化。对于细胞基质样品,参考病毒核酸提取试剂盒说明书里的细胞基质方法 2 流程进行病毒核酸提取(具体步骤请参考病毒核酸提取试剂盒说明书)。

2.    待测样品提取纯化液在进行 RT-qPCR 检测前先进行热处理,95℃,3 分钟后,暂时保存于 4℃冰箱。

l 阳性对照品(PCS)

使用 REO-3 阳性对照品作为阳性对照 PCS,在提取阶段和同批待测样品一起进行相同的样品前处理,制备成 PCS 纯化液用于 RT-qPCR 检测。

l 阴性对照品(NCS)

使用样品基质溶液(或 RNase-Free H2O)作为阴性对照 NCS,在提取阶段和同批待测样品一起进行相同的样品前处理,制备成 NCS 纯化液用于RT-qPCR检测。

(三)RT-qPCR 反应液准备:

1.       根据所要检测样品数量,计算所需反应孔数,一般做 2 个重复孔/样。反应孔数 =(1 个无模板对照 NTC + 1 个阴性质控样品 NCS+1 个阳性质控样品 PCS + N 个待测样品)×2

2.       MIX 总量计算:根据反应孔数计算所需的 RT-qPCR MIX 总量。RT-qPCR MIX =(反应孔数 + 2)× 10μL(含有 2 孔的损失量)

3.       根据表 2 准备各试剂 RT-qPCR MIX 用量。

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二、操作步骤

(一)加样

1.    将所有溶液振荡混匀后按表 3 和表 4 所示加样:

 

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²  该示例表示的是检测 1 个阴性质控样品 NCS、1 个无模板对照 NTC、1

个阳性质控样品 PCS、5 个待测样品。每个检测做 2 个重复孔。

²  实际检测时可根据样品多少,参照表 4 示例进行 96 孔板排版加样。

(二)程序参数设置

将八联管用配套管盖盖紧或 96 孔板用光学膜封闭,轻微震荡混匀,短时间快速离心 10 秒后放入 qPCR 仪,接着进行 RT-qPCR 程序设置:

l  SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例:

1.         点击“实验向导”。

2.         “孔板编辑”页面中选择步骤 1:选择反应孔。


 

3.         选择步骤 2:选择项目中的“REO-3 病毒检测”程序。

4.         “实验运行”页面中点击“开始”运行程序。

l  其他定量 PCR 系统程序设置如下:

1.         创建空白新程序,选择绝对定量检测模板。

2.        创建新检测探针,命名为“REO-3”,选择报告荧光基团为 FAM,猝灭荧光基团为 none;创建 VIC 探针,选择报告荧光基团为 VIC,猝灭荧光基团为 none,检测参比荧光为 ROX(可选)。

3.        设置 RT- qPCR 反应程序: 50 ℃ 逆转录 15 分钟; 95 ℃ 预变性 30 秒;

95 ℃ 15 秒,60 ℃ 1 分钟(读取荧光),45 个循环;

反应体积 20 μL。

三、结果计算与判断

(一)结果计算

l  1、以 SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例。

1.        “孔板编辑”页面中步骤 3:定义反应孔,将 NTC 孔的样品类型设置为无模板对照,NCS 孔设置为阴性对照,待测样品孔设置为待测样品。

2.        在“实验分析”页面点击, 在“反应孔信息表中”可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值。

l  以 7500 Real-Time PCR System、软件版本 1.4 为例:

1.        在 Results 的 Amplification Plot 面板中,将 Threshold 设置为 0.02,点击 Analyze,此时可初步查看扩增曲线的形态是否正常。

2.        在 Results 的 Plate 面板中,将无模板对照 NTC 孔的 Task 一栏设置为 NTC,将阴性质控 NCS 孔、待测样品孔、PCS 孔的 Task 一栏设置为 Unknown,并且在相应的 Sample Name 一栏中命名为 NTC、NCS、S、 PCS,之后点击。

3.         在 Results 的 Report 面板中,Mean Quantity 一栏可读取无模板对照

NTC、阴性质控 NCS、待测样品、PCS 的检测值。

 上述示例结果分析的参数设置仅供参考,具体需依据实验室机型及使用


 

的软件版本进行设定,一般也可由仪器自动判读。

(二)结果判断

1.         NTC、NCS、PCS 检测结果参考表 5:

 

表 5.质控结果分析

 

质控样品

FAM 信号

VIC 信号

NTC

2 复孔Ct≥40 或扩增曲线无明显起峰

2 复孔 Ct<35>且有效的“S”型扩增

NCS

2 复孔Ct≥40 或扩增曲线无明显起峰

2 复孔 Ct<35>且有效的“S”型扩增

PCS

2 复孔 Ct<35>且有效的“S”型扩增

2 复孔 Ct<35>且有效的“S”型扩增

*质控标准应基于实验室验证数据,可从满足检测限要求考虑。

 

2.         待测样品检测结果判定参考表 6:

 

表 6.待测样品检测结果分析

 

FAM 信号

VIC 信号

结果判断

2 复孔有 1 孔以上

Ct<40>且有效的“S”型扩增

2 复孔 Ct<40>且有效的“S”型扩增

阳性

2 复孔 Ct≥40 或扩增曲线无明显起峰

阳性,有抑制

2 复孔 Ct≥40 或扩增曲线无明显起峰

2 复孔 Ct<40>且有效的“S”型扩增

阴性

2 复孔 Ct≥40 或扩增曲线无明显起峰

阴阳性无法判断,有抑制

* VIC 信号如果有抑制,需重测或对样品进行合适处理消除抑制因子。

 

 

生效日期:2023 年 05 月 29 日



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