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CAR/TCR 基因拷贝数检测试剂盒 (多重PCR-荧光探针法)
100测试
Cat No. SK030221CA100
库存:现货
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产品介绍

产品信息:

• 检测类型:定量检测

• 产品规格:100测试

• 适用样品类型:对来源于常见的HIV-1型慢病毒载体技术制备的人源细胞产品目的基因拷贝数进行分析。

• 线性范围:CAR/TCR(2.33×101~2.33×107pg/μL;R2≥0.990;扩增效率为94.9%),SCG(2.33×101~2.33×107copies/μL;R2≥0.990;扩增效率为94.8%)

• 样品回收率:50-150%

• LLOQ:CAR\TCR(2.33×101 copies/μL),SCG(5.825×101 copies/μL)

• 专属性:不受CHO、Vero、NS0和MDCK等常见工程细胞基因组DNA的干扰。

• 精密度:中间精密度及重复性实验CV值均在15%以内。

• 耐用性:至少反复冻融5次检测性能不受影响。

• 仪器适用性(包括但不限于以下设备):湖州申科SHENTEK-96S、Thermo ABI7500、Bio-Rad CFX-96、博日FQD-96A


产品特点:

• 操作简单:搭配SHENTEK前处理设备及试剂盒,可实现自动化提取及检测。

• 灵敏度高:定量限CAR\TCR(2.33×101 copies/μL),SCG(5.825×101 copies/μL),满足实际检测需求。

• 性能稳定:试剂盒重复实验间结果稳定,均满足精密度需求。

• 质量可控:试剂盒按照药典、法规完成各项检测指标的性能验证。


质量保证:

• 建立ISO13485质量管理体系,具有完善的从研发、生产、质检的产品开发流程。

• 生产高度设备化,历史多批次生产稳定,供应链完善。

n 剂盒简介

SHENTEK® CAR/TCR 基因拷贝数检测试剂盒适用于定量检测来源于常见的 HIV-1慢病毒载体技术制备的人源细胞产品中目的基因的拷贝数CAR-T TCR-T 细胞基因组中 CAR TCR 基因的拷贝数。

本试剂盒基于荧光探针法,采用多重 qPCR 的方法分别检测转移质粒上与整合或表达功能相关的 DNA 序列和人体细胞中单拷贝基因(Single Copy GeneSCG)的方法,计算得到样品中平均每个细胞的目的基因拷贝数,如 CARTCR 基因拷贝数水平。本试剂盒检测快速,专一性强,性能可靠,针对慢病毒载体技术具有通用性。试剂盒配套有本公司构建的定量参考品。

n  试剂盒组

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n 

100 Reactions

n  有效期

规定储存条件下 24 个月,具体详见试剂盒标签。

n 适用机型(包括但不限于

Ø SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统

Ø 7500 Real-Time PCR System

Ø CFX96 定量 PCR 系统

Ø Linegene 9600plus 定量 PCR 系统

n 实验所需但试剂盒中未含材料

Ø 1.5 mL 低吸附无菌离心管

Ø qPCR 反应板或条

Ø 1000 μL100 μL10 μL 无菌有滤芯低吸附枪头

n  相关设

Ø 荧光定量 PCR

Ø 1000 μL100 μL10 μL 移液枪

n  操作过

v  CAR/TCR  定量参考品的稀释和标准曲线的制备

 CAR/TCR 定量参考品浓度标注于管壁标签,请确认后再进行稀释。通过以下公式来换算拷贝数:

质粒拷贝数(copies/μL=6.02 × 1014 × 质粒浓度(ng/μL/(质粒碱基数 × 660得到:CAR/TCR SCG 基因拷贝数均为 2.33 × 108 copies /μL

用试剂盒中提供的 DNA 稀释液将 CAR/TCR 定量参考品进行 10 倍梯度稀释,具体操作如下:

1.  将试剂盒中的定量参考品和 DNA 稀释液置于冰上或 2-8 ℃条件下融化,待完全融化后,轻弹数下混匀,短时间快速离心 3-5 s,如此重复 3 次。

2. 6 支干净的 1.5 mL 离心管,分别标记为 ST0ST1ST2ST3ST4ST5

3. ST0 管中用 DNA 稀释液将定量参考品稀释 10 倍,得到 ST0,振荡混匀后短时间快速离心 3-5 s,重复 3 次以确保定量参考品与 DNA 稀释液充分混匀。

4. ST1ST2ST3ST4ST5 管中分别加入 90 μL DNA 稀释液。

5. 按表 2 依次进行 5 次稀释操作。

 

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 已融化未使用的 DNA 稀释液可保存于 2-8 ℃

 DNA 稀释液中有析出,建议于 37 ℃条件下进行孵育。

v  阴性质控 NCS 的制备

1.   建议随行阴性质控样品 NCSDNA 稀释液)同样品一起进行前处理,制备成阴性质控 NCS 纯化液。

v  qPCR 反应液的制

2.       根据所要检测的标准曲线及待测样品数量,计算所需反应孔数,一般做 3 个重复/样。反应孔数=5 个浓度梯度的标准曲线+1 个无模板对照NTC+1 个阴性质控样品NCS+待测样品数)× 3

3.  根据反应孔数计算本次所需的 qPCR MIX 总量(含有 2 孔的损失量

 

 qPCR MIX =(反应孔数+2× 20 μL

4.       各试剂置于冰上或 2-8条件下融化,轻微振荡混匀,按表 3 所示加样:

image.png

v 

1.    上述各试剂置于冰上,轻微震荡混匀,按表 4 所示加样:

image.png

 加样完成后每孔总体积为 30 μL

image.png

 

该示例表示的是检测 5 个浓度梯度的标准曲线ST1-ST51 个无模板对照 NTC1 个阴性质控样品 NCS3 个待测样品(S1-S3。每个检测做 3 个重复孔。

实际检测时可根据样品多少,参照此示例进行 96 孔板排版加样。待测样品的每孔上样总量推荐 5 ng-30 ng 区间,可根据预实验情况适当调整。

2.    96 孔板用光学膜封闭,轻微震荡混匀,短时间快速离心 10 s 后放入 qPCR 仪。

v  qPCR 程序设

² SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例。

1.    点击“实验向导”。

2.    “孔板编辑”页面中选择步骤 1:选择反应孔。

3.    选择步骤 2:选择项目中的“CAR-TCR 拷贝数检测”程序。

4.    “实验运行”页面中点击开始运行程序。

² 其他定量 PCR 系统程序设置如下:

1. 创建空白新程序,选择绝对定量检测模板。

2. 创建新检测探针,命名为 CAR TCR,选择报告荧光基团为 FAM,猝灭荧光基团为 none;创建新检测探针,命名为 SCG,选择报告荧光基团为 CY5,猝灭荧光基团为 none;创建新检测探针,命名为 IPC,选择报告荧光基团为 VIC,猝灭荧光基团为 none;检测参比荧光为 ROX(可选

3. 设置两步法反应程序:95 ℃预变性 10 min95 ℃ 15 s60 ℃ 1 min(读取荧光40 个循环;反应体积 30 μL

 

v  qPCR 结果分

² SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例。

1.  “孔板编辑”页面中步骤 3:定义反应孔,将标准曲线孔的选择样品类型设置为标准品,并在标品赋值中分别根据表 2 赋值,通道 1”分别设为 2.33 ×1062.33 ×1052.33 ×1042.33 ×1032.33 ×102通道 4”分别设为 2.33 ×1062.33 ×1052.33 ×1042.33 ×1032.33 ×102单位为 copies/μL,并且在相应的样本名称中命名为 ST1ST2ST3ST4ST5

2.  待测样品将样品类型设置为待测样品,NTC 将样品类型设置为无模板对照。

3. 在“实验分析”页面点击image.png,可读取标准曲线的斜率、截距、相关系数、扩增效率。

4. 在“反应孔信息表中”可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值,单位为 copies/μL

²  7500 Real-Time PCR System、软件版本 1.4 为例。

通过选择不同的探针,对 CAR TCR 基因及 SCG 基因进行分析。

1.  Results Amplification Plot 面板中,将 Threshold 设置为 0.02,点击 Analyze此时可初步查看扩增曲线的形态是否正常。

2. Results Plate 面板中,将标准曲线孔的 Task 一栏设置为 Standard,并且在 Quantity 一栏分别根据表 2 赋值,例如 SCG 设为 2.33e+0062.33e+0052.33e+0042.33e+0032.33e+002单位为 copies/μL),并且在相应的 Sample Name 一栏中命名为 ST1ST2ST3ST4ST5

3. Results Plate 面板中,将无模板对照 NTC 孔的 Task 一栏设置为 NTC,将待测样品孔的 Task 一栏设置为 Unknown,并且在相应的 Sample Name 一栏中命名为 NTCNCSS 之后点击。

4. Results Standard Curve 面板中,可读取标准曲线的斜率Slope、截距InterceptR2

5. Results Report 面板中,Mean Quantity 一栏可读取无模板对照 NTC、阴性质NCS、待测样品的 CAR TCR SCG 检测值,单位为 copies/μL

6. 无模板对照 NTC 检测结果应大于标准曲线最低浓度点的 Ct 值。

7. 分析 IPC Ct 值,正常情况下样品的 Ct-IPC 值应该与阴性质控 NCS Ct-IPC值一致或±1。如样品的 Ct-IPC 值与阴性质控 NCS Ct-IPC 值相比明显增大,则表明样品可能存在抑制。

8. 结果计算:CAR TCR copies/cell = 2 × CAR TCR/SCG

 上述示例结果分析的参数设置仅供参考,具体需依据实验室机型及使用的软件版本进行设定,一般也可由仪器自动判读。

 

修订日期:2023 03 23

生效日期:2023 03 29




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