逆转录酶活性检测试剂盒,符合《中国药典》2020版逆转录酶活性检查法,利用MS2 RNA为模板,经反转录后再采用荧光探针qPCR技术检测特异性扩增信号。
试剂盒适用于生物制品生产检定用动物细胞基质制备及检定过程;但鸡胚成纤维细胞(CEF或其他禽源性细胞、小鼠及其他啮齿类动物来源的细胞系常含有逆转录病毒基因序列,其逆转录酶活性检测常为阳性。对此,建议按照法规要求采用其他方法进行相应检测。
n 试剂盒简介
逆转录酶活性检测试剂盒,符合《中国药典》2020 版逆转录酶活性检查法,利用MS2 RNA 为模板,经反转录后再采用荧光探针 qPCR 技术检测特异性扩增信号。
试剂盒适用于生物制品生产检定用动物细胞基质制备及检定过程;但鸡胚成纤维细胞(CEF)或其他禽源性细胞、小鼠及其他啮齿类动物来源的细胞系常含有逆转录病毒基因序列,其逆转录酶活性检测常为阳性。对此,建议按照法规要求采用其他方法进行相应检测。
n 试剂盒组分
100×ROX 解冻后于 2-8 ℃、避光保存。
50 Reactions。
规定储存条件下 12 个月,具体详见试剂盒标签。
Ø SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统
Ø 7500 Real-Time PCR System
Ø CFX96 定量 PCR 系统
Ø Lin
Gene 9600 定量 PCR 系统
Ø 10 mg/mL RNase A,用户自备
Ø 阳性对照品,联系本公司订购(逆转录酶活性检测阳性对照 PC,货号:1505701)
Ø 1.5 mL RNase Free 低吸附离心管
Ø qPCR 反应板或八联管
Ø 1000 μL,100 μL,10 μL RNase Free 低吸附带滤芯枪头
Ø 荧光定量 PCR 仪
Ø 1000 μL,100 μL,10 μL 移液枪
n 操作过程
v M-MLVRT 定量参考品稀释、标曲样品和灵敏度供试品准备
M-MLVRT 定量参考品浓度(200 U/μL)标注于管壁标签上, 请确认浓度后再进行稀释。
用试剂盒中提供的 A 液将 M-MLVRT 定量参考品进行 10 倍梯度稀释,具体操作如下:
1. 将试剂盒中的 M-MLVRT 定量参考品和 A 液置于冰上或 2-8 ℃条件下融化。待完全融化后,轻弹数下混匀,短时间快速离心 3-5 s,如此重复 3 次。
2. 取 9 支无菌的 1.5 mL RNase Free 低吸附离心管,分别标记为 ST0,ST1,ST2, ST3,ST4,ST5,ST6,ST7,ST8。
3. 在 ST0 管中加入 398 μL A 液,其余各管分别加入 45 μL A 液。
4. 直接吸取 2 μL 的 M-MLVRT 定量参考品,加入 ST0 管中液面以下,反复吹吸 10次后弃去枪头,瞬时振荡混匀后短时间快速离心 3-5 s,重复振荡离心 2 次以确保充分混匀,混匀的 ST0 管可于-18 ℃以下稳定保存 1 个月。
5. 按表 2 依次进行稀释,吸头直接吸液后,加入液面下反复吹吸 10 次后弃去枪头,瞬时振荡混匀后短时间快速离心 3-5 s,重复振荡离心 2 次以确保充分混匀。
6. 标准曲线为 ST3,ST4,ST5,ST6,ST7,ST8。可根据实际验证结果选择,应至少有 5 个浓度点。
7. 用户首次使用本产品应进行检测系统灵敏度测试,灵敏度供试品为 ST8,反转录重复 10 管,qPCR 每管各检测 1 孔,共 10 孔。
取供试品 200 μL,5000 转/min,离心 5 min,取上清液 20 μL,加入 B 液 20 μL,混匀后,置冰浴 15 min,此为已处理供试品,置-65 ℃保存备用。
反转录供试品准备:取已处理供试品 5 μL,加入 45 μL A 液中,反复吹吸 10 次混匀,瞬时振荡混匀后短时间快速离心 3-5 s,重复振荡离心 2 次以确保充分混匀。检测时根据需要,可依次连续稀释至合适的浓度。
v 阳性对照品、阴性对照品的准备
1. 阳性对照品:联系本公司订购。依照供试品的准备步骤处理,按单次用量分装,置-65 ℃保存备用。
2. 阴性对照品:A 液。依照供试品的准备步骤处理。
v 反转录反应液(RT-MIX)的准备和反转录
1. 根据待检测样品的数量(N),计算所需反应管数。
RT 反应管数= 6 个浓度梯度的标准曲线+N 个供试品+1 个阴性对照品+1 个阳性对照品(首次使用时应额外增加 10 管灵敏度供试品)
2. 根据反应管数计算所需反转录反应液的总量(含有 2 孔的损失量):RT-MIX =(RT 反应孔数+2)× 20 μL
3. 各试剂放在冰上或 2-8 ℃条件下融化,轻微振荡混匀,根据表 3 所示准备 RT-MIX:
4. 将 RT-MIX 置于 70 ℃ 孵育 10 min 后,立即置于冰上至少 5 min 后,瞬时振荡混匀后短时间快速离心 3-5 s,重复振荡离心 2 次以确保充分混匀,然后 20 μL/管分装于 1.5 mL RNase Free 低吸附离心管或 PCR 联管或 96 孔板中。
5. 按表 4 所示加样,移取相应样品,加入 RT-MIX 中,反复吹吸 10 次后弃去枪头,盖紧管盖或密封,瞬时振荡混匀后短时间快速离心 3-5 s。加样完成后每管总体积为 25 μL。
6. 反应管置于 37 ℃,4 h 后,得到反转录产物,瞬时振荡混匀后短时间快速离心3-5 s,可立即进行 qPCR 反应检测,或-20 ℃保存过夜,次日检测。
1. 根据 RT 反应管数,计算所需 qPCR 反应孔数,一般每个 RT 反应管做 3 个重复孔:qPCR 反应孔数=RT 反应管数 × 3
2. 根据反应孔数计算所需 qPCR MIX 的总量(含 2 孔的损失量):qPCR MIX=(qPCR 反应孔数+2)× 25 μL
3. 各试剂放在冰上或 2-8 ℃条件下融化,轻微振荡混匀,根据表 5 所示准备 RT-qPCR MIX:
注意:
qPCR MIX 中含有 RNase A,其配制与加样应与反转录操作区域有效隔离。
ROX 的用量应根据 qPCR 仪器厂家型号由用户自行确定,如 7500 Real-Time PCR System 型用量 0.1 μL,CFX96 Real-Time PCR System 型用量 0 μL。
4. 可参照表 6 所示将 qPCR MIX 25 μL/孔分装于 96 孔板中,移取 5 μL 反转录产物加入相应孔中。加样完成后每孔总体积为 30 μL。
该示例表示的是检测 6 个浓度梯度的逆转录酶标准曲线(ST3-ST8)、10 个灵敏度 ST8(来自 10 个反转录反应 RT1、RT2、RT3.................. RT10)、1 个阳性对照 PC、1 个阴性
对照 NC、2 个待测样品(S1 和 S2)。 除灵敏度外其余每个检测做 3 个 qPCR 重复孔。
实际检测时可根据样品多少,参照此示例样进行 96 孔板排版加样。
5. 将 96 孔板用光学膜封闭,快速离心 20 s 后放入 qPCR 仪。
² SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例。
1. 点击“实验向导”。
2. “孔板编辑”页面中选择步骤 1:选择反应孔。
3. 选择步骤 2:选择项目中的“逆转录酶活性检测”程序。
4. “实验运行”页面中点击“开始”运行程序。
² 其他定量 PCR 系统程序设置如下:
1. 创建空白新程序,选择绝对定量检测模板。
2. 创建新检测探针,命名为 RT,选择报告荧光基团为 FAM,猝灭荧光基团为 none;检测参比荧光为 ROX(可选)。
3. 设置反应程序:37 ℃ 7 min;95 ℃预变性 5 min;95 ℃ 20 s, 57 ℃ 1 min(读取荧光),72 ℃ 10 s,50 个循环;最后 72 ℃延伸 2 min;反应体积 30 μL。
v qPCR 结果分析
² 以 SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例。
1. “孔板编辑”页面中步骤 3:定义反应孔,将标准曲线孔的选择样品类型设置为标准品,并在标品赋值中分别根据表 2 赋值,设为 109、108、107、106、105、104(单位为 pU /μL),并且在相应的“样本名称”中命名为 ST3、ST4、ST5、ST6 、ST7、ST8。
2. 待测样品将样品类型设置为待测样品,NTC 将样品类型设置为无模板对照。
3. 在“实验分析”页面点击,可读取标准曲线的斜率、截距、相关系数、扩增效率。
4. 在“反应孔信息表中”可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值。
² 以 7500 Real-Time PCR System、软件版本 1.4 为例。
1. 在 Results 的 Amplification Plot 面板中,将 Threshold 设置为 0.02,点击 Analyze,此时可初步查看扩增曲线的形态是否正常。
2. 在 Results 的 Plate 面板中,将标准曲线孔的 Task 一栏设置为 Standard,并且在 Quantity 一栏分别根据表 2 赋值,设为 109、108、107、106、105、104(单位为 pU /μL),并且在相应的 Sample Name 一栏中命名为 ST3、ST4、ST5、ST6、ST7、ST8。
3. 在 Results 的 Plate 面板中,将灵敏度检测孔、阳性对照 PC 孔、阴性对照 NC 孔、供试品孔、加标质控样品 ERC 孔的 Task 一栏设置为 Unknown,并且在相应的 Sample Name 一栏中命名,之后进行数据分析。
4. 在 Results 的 Standard Curve 面板中,可读取标准曲线的斜率(Slope)、截距(Intercept)、R2。
5. 在 Results 的 Report 面板中,Mean Quantity 一栏可读取各检测值,单位为 pU/μL。结果分析的参数设置需依据具体的机型及使用的软件版本, 一般也可由仪器自动判读。
1. 实验方法灵敏度认可标准
10 个 104 pU/μL(ST8)供试品应全部检出,实验灵敏度合格。
2. 试验有效性
标准曲线 R2 不低于 0.96,阳性对照 Ct≤28;灵敏度供试品 Ct≤38,视为试验有效。
3. 待测样品结果判定
(1) 如果待测样品无 Ct 值结果,或 Ct 值≥40,且无明显的扩增曲线,则判定待测样品中逆转录酶活性为阴性。
(2) 如果待测样品 Ct 值<40<>,且有明显的扩增曲线,则按照下式计算样品中逆转录酶活性单位:待测样品中逆转录酶活性单位(pU/mL)=A × D × 1000 式中 A 为测定平均值,pU/μL;D 为样品稀释倍数,D=20。
(3) 如果待测样品 Ct 值位于 38-40 之间,建议重复测定 1 次,如重复测定 Ct 值<40<>,且有明显的扩增曲线,则判定为阳性。上述示例结果分析的参数设置仅供参考,具体需依据实验室机型及使用的软件版本进行设定,一般也可由仪器自动判读。
修订日期:2023 年 04 月 24 日
生效日期:2023 年 04 月 28 日
400-829-0116