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SV40LTA&E1A 残留DNA检测试剂盒 (2G)(多重 PCR-荧光探针法)
100测试
Cat No. 1403443
库存:现货
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产品介绍

产品信息:

• 检测类型:定量检测

• 产品规格:100测试

• 适用样品类型:对各种生物制品及药品的中间品、半成品和成品中残留的HEK293T细胞来源的E1A及SV40LTA DNA进行分析。

• 线性范围:SV40LTA(4.67×101~4.67×106pg/μL;R2≥0.990;扩增效率为97.5%),E1A(4.97×101~4.97×106copies/μL;R2≥0.990;扩增效率为98.3%)

• 样品回收率:50-150%

• LLOQ:Sv40(9.34 copies/μL),E1A(4.97×101 copies/μL)

• 专属性:不受NS0&SP2/0、E.coli、MDCK、毕赤酵母、Vero、Sf9等常见工程细胞基因组DNA的干扰。

• 精密度:中间精密度及重复性实验CV值均在30%以内。

• 耐用性:至少反复冻融5次检测性能不受影响。

• 仪器适用性(包括但不限于以下设备):湖州申科SHENTEK-96S、Thermo ABI7500、Bio-Rad CFX-96、博日FQD-96A、Roche LightCycler480

产品特点:

• 操作简单:搭配SHENTEK前处理设备及试剂盒,可实现自动化提取及检测。

• 灵敏度高:定量限SV40LTA(9.34 copies/μL),E1A(4.97×101 copies/μL),满足实际检测需求。

• 性能稳定:试剂盒重复实验间结果稳定,均满足精密度需求。

• 质量可控:试剂盒按照药典、法规完成各项检测指标的性能验证。

质量保证:

• 建立ISO13485质量管理体系,具有完善的从研发、生产、质检的产品开发流程。

• 生产高度设备化,历史多批次生产稳定,供应链完善。

n  试剂盒简介

SHENTEK® SV40LTA & E1A 残留 DNA 检测试剂盒(2G)用于定量检测生物制品中宿主细胞,如 HEK 293T 细胞,来源的 SV40 LTA 和 E1A 残留 DNA 的专用试剂盒。

本试剂盒利用荧光探针原理,采用多重 qPCR 的方法定量检测样品中 SV40LTA 和 E1A 残留 DNA。检测快速,专一性强,性能可靠,最低检测限可以达到 101 copies/μL。试剂盒配套有 SV40 LTA & E1A 定量参考品。本试剂盒与 SHENTEK®宿主细胞残留 DNA样本前处理试剂盒配套使用,可准确定量样品中残留的 SV40LTA 和 E1A 微量 DNA。

n  试剂盒组

image.png

 n 

100 Reactions。

n  有效期

规定储存条件下 24 个月,具体详见试剂盒标签。

n  适用机型(包括但不限于

Ø SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统

Ø 7500 Real-Time PCR System

Ø CFX96 定量 PCR 系统

n 实验所需但试剂盒中未含材料

Ø 1.5 mL 无菌低吸附离心管

Ø 96 qPCR 板或八联管

Ø 1000 μL100 μL10 μL 无菌低吸附带滤芯枪头

n  相关设

Ø 迷你离心机

Ø 漩涡振荡器

Ø 荧光定量 PCR

Ø 1000 μL100 μL10 μL 移液枪

v  SV40LTA & E1A 定量参考品的稀释和标准曲线的制备

SV40LTA & E1A 线性化DNA 定量参考品:将线性化 DNA 定量参考品快速离心 15 s,准确移取 55 μL ddH2O 加至管底,溶解冻干粉,浓度为 20 ng/μL。

为保证冻干粉充分溶解,轻弹数下混匀,短时间快速离心 3-5 s,如此重复 3 次,再静置 10 min 后使用。

SV40LTA & E1A 非线性化 DNA 定量参考品浓度为 12 ng/μL。

通过如下公式换算成拷贝数,得到线性化 SV40LTA 的浓度为 4.67 × 109 copies/μL,线性化 E1A 的浓度为 4.97 × 109 copies/μL; 非线性化 SV40LTA 的浓度为 2.80 × 109 copies/μL,非线性化 E1A 的浓度为 2.98 × 109 copies/μL。

公式:质粒拷贝数(copies/μL)=6.02 × 1014 × 质粒浓度(ng/μL)/(质粒碱基数 × 660)用试剂盒中提供的 DNA 稀释液将定量参考品进行 10 倍梯度稀释,具体操作如下:

1.        将试剂盒中的SV40LTA & E1A 定量参考品和DNA 稀释液置于冰上或 2-8 ℃条件下融化,待完全融化后,轻弹数下混匀,短时间快速离心 3-5 s,如此重复 3 次。

 可根据自身样品结构特性选择线性化或非线性化 DNA 定量参考品配制标曲。

2.        如使用 SV40LTA & E1A 非线性化 DNA 定量参考品,则取 7 支干净的 1.5 mL 离心管,分别标记为 ST、ST0,ST1,ST2,ST3,ST4,ST5。如使用 SV40LTA & E1A 线性化 DNA 定量参考品,则取 8 支干净的 1.5 mL 离心管,分别标记为 ST,ST0,ST1, ST2,ST3,ST4,ST5,ST6。

3.        在 ST 管中用 DNA 稀释液将 SV40LTA & E1A 定量参考品稀释 10 倍,得到 ST。振荡混匀短时间快速离心 10 s 后,再在 ST0 管中用 DNA 稀释液将 ST 稀释 10 倍,得到 ST0,振荡混匀后短时间快速离心 10 s。

4.        在 ST1,ST2,ST3,ST4,ST5 管中分别加入 90 μL DNA 稀释液。

5.        按表 2 依次进行稀释操作。

image.png

已融化未使用的 DNA 稀释液可保存于 2-8 ℃。

若 DNA 稀释液中有析出,建议于 37 ℃条件下进行孵育。

标准曲线浓度点可根据实际验证结果选择,应至少有 5 个浓度点。

v  阴性质控 NCS 的制备

根据实验设置阴性质控,具体操作如下:

1.取 100 μL 样品基质溶液(或DNA 稀释液)加入 1.5 mL 干净的离心管中标记为阴性质控 NCS。

阴性质控 NCS 和同批待测样品一起进行样品前处理,制备成阴性质控 NCS 纯化液。

v  qPCR 反应液的制备和加样

1.    根据所要检测的标准曲线及待测样品数量,计算所需反应孔数,一般做 3 个重复孔/样。

反应孔数=(各浓度梯度标准曲线+1 个无模板对照 NTC+1 个阴性质控 NCS +待测样品)× 3

2.    根据反应孔数计算本次所需的 qPCR MIX 总量:

qPCR MIX =(反应孔数+2)× 20 μL(含有 2 孔的损失量)

3.    各试剂放在冰上或 2-8 ℃条件下融化,并根据表 3 所示准备 qPCR MIX:

image.png

4.    上述各试剂置于冰上,混匀,按表 4 所示加样:

image.png

加样完成后每孔总体积为 30 μL。

image.png

该示例表示的是检测 5 个浓度梯度的 SV40 LTA & E1A 标准曲线(ST1-ST5)、1个无模板对照 NTC、1 个阴性质控 NCS、5 个待测样品(S1-S5)。每个检测做 3 个重复孔。

实际检测时可根据样品多少,参照此示例进行 96 孔板排版加样。

5.    将 96 孔板用光学膜封闭,轻微震荡混匀,短时间快速离心 10 s 后放入 qPCR 仪。

v  qPCR 程序设置

² SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例。

1.    点击“实验向导”。

2.    “孔板编辑”页面中选择步骤 1:选择反应孔。

3.    选择步骤 2:选择项目中的“SV40LTA & E1A 残留 DNA”程序。

4.    “实验运行”页面中点击“开始”运行程序。

² 其他定量 PCR 系统程序设置如下:

选择 FAM 检测通道代表 SV40LTA,选择 CY5 检测通道代表 E1A。

1.    创建空白新程序,选择绝对定量检测模板。

2.    创建新检测探针,命名为 SV40LTA-DNA,选择报告荧光基团为 FAM,猝灭荧光基团为 none;创建新检测探针,命名为 E1A-DNA,选择报告荧光基团为 CY5,猝灭荧光基团为 none;创建新检测探针,命名为 IPC,选择报告荧光基团为 VIC,猝灭荧光基团为 none;检测参比荧光为 ROX(可选)。

3.    设置两步法反应程序:95 ℃ 预变性 10 min;95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min(读取荧光), 40 个循环;反应体积 30 μL。

v  qPCR 结果分析

² 以 SHENTEK-96S 实时荧光 PCR 检测系统、软件版本 8.2.2 为例。

1.       “孔板编辑”页面中步骤 3:定义反应孔,将标准曲线孔的选择样品类型设置为标准品,并在标品赋值中分别根据表 2 赋值,例如非线性化 SV40LTA 设为 2.80e+006、 2.80e+005、2.80e+004、2.80e+003、2.80e+002(单位为 copies/μL),并且在相应的“样本名称”中命名为 ST1、ST2、ST3、ST4、ST5。

2.       待测样品将样品类型设置为待测样品,NTC 将样品类型设置为无模板对照。

3.       在“实验分析”页面点击image.png,可读取标准曲线的斜率、截距、相关系数、扩增效率。

4.       在“反应孔信息表中”可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值,单位为 copies/μL。

以 7500 Real-Time PCR System、软件版本 1.4 为例。

1.       在 Results 的 Amplification Plot 中,将 Threshold 设置为 0.02,点击 Analyze,此时可初步查看扩增曲线的形态是否正常。

2.       在 Results 的 Plate 中,将标准曲线孔的 Task 一栏设置为 Standard,并且在 Quantity一栏分别根据表 2 赋值,例如非线性化 SV40LTA 设为 2.80e+006、2.80e+005、2.80e+004、 2.80e+003、2.80e+002(单位为 copies/μL),并且在相应的 Sample Name 一栏中命名为 ST1、ST2、ST3、ST4、ST5。

3.       在 Results 的 Plate 中,将无模板对照 NTC 孔的 Task 一栏设置为 NTC,将阴性质控 NCS 孔、待测样品孔的 Task 一栏设置为 Unknown,并且在相应的 Sample Name 一栏中命名为 NTC、NCS、S,之后点击图片1.jpg

4.       在 Results 的 Standard Curve 中,可读取标准曲线的斜率(Slope)、截距(Intercept)、

R2。

5.       在 Results 的 Report 中,Mean Quantity 一栏可读取无模板对照 NTC、阴性质控 NCS、待测样品的检测值,单位为 copies/μL。

6.       样品的 Ct-IPC 值与 NCS 的 Ct-IPC 值要求在±1 个 Ct 值范围内,如样品的 Ct-IPC值与 NCS 的 Ct-IPC 值相比明显增大,则表明样本可能有抑制。如同时测试加标样品,则优先考虑样品回收率结果,IPC 结果作为参考。

7.       SV40LTA 的 NTC 检测均值应不超过 14.32 copies/μL,E1A 的 NTC 检测均值应不超过 17.79 copies/μL,或根据实验室自身验证结果设定具体标准。NCS 的 Ct 均值应大于标曲最低浓度 Ct 均值,若经验证的定量限浓度低于标曲最低浓度,则 NCS 的检测值应小于定量限浓度。

上述示例结果分析的参数设置仅供参考,具体需依据实验室机型及使用的软件版本进行设定,一般也可由仪器自动判读。

 

修订日期:2023 03 06

 

 


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